Resultate

Gefundene snoRNA-Gene aus der D.plexippus Annotation

JH384466 EnsemblGenomes snoRNA 3802 3872 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000567 PARENT=gene:EMDPLG00000000567
JH387043 EnsemblGenomes snoRNA 5457 5539 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000463 PARENT=gene:EMDPLG00000000463
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 3566 3770 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000648 PARENT=gene:EMDPLG00000000648
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 3565 3770 . - . ID=transcript:EMDPLT00000001034 PARENT=gene:EMDPLG00000001034
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 13611 13815 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000130 PARENT=gene:EMDPLG00000000130
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 16200 16402 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000278 PARENT=gene:EMDPLG00000000278
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 17661 17866 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000682 PARENT=gene:EMDPLG00000000682
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 16200 16401 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000734 PARENT=gene:EMDPLG00000000734
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 13611 13816 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000761 PARENT=gene:EMDPLG00000000761
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 19003 19207 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000771 PARENT=gene:EMDPLG00000000771
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 17662 17866 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000872 PARENT=gene:EMDPLG00000000872
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA 19003 19208 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000983 PARENT=gene:EMDPLG00000000983
JH386205 EnsemblGenomes snoRNA 2746 2816 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000939 PARENT=gene:EMDPLG00000000939
JH392349 EnsemblGenomes snoRNA 27144 27214 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000021 PARENT=gene:EMDPLG00000000021
JH383628 EnsemblGenomes snoRNA 24820 24952 . - . ID=transcript:EMDPLT00000001075 PARENT=gene:EMDPLG00000001075
JH383628 EnsemblGenomes snoRNA 26329 26458 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000826 PARENT=gene:EMDPLG00000000826
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA 7786 7866 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000019 PARENT=gene:EMDPLG00000000019
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA 7322 7391 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000452 PARENT=gene:EMDPLG00000000452
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA 7566 7635 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000969 PARENT=gene:EMDPLG00000000969
JH384338 EnsemblGenomes snoRNA 65834 65965 . - . ID=transcript:EMDPLT00000000586 PARENT=gene:EMDPLG00000000586
JH384078 EnsemblGenomes snoRNA 51538 51673 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000808 PARENT=gene:EMDPLG00000000808
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA 48204 48403 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000230 PARENT=gene:EMDPLG00000000230
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA 49371 49569 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000731 PARENT=gene:EMDPLG00000000731
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA 50207 50340 . + . ID=transcript:EMDPLT00000001100 PARENT=gene:EMDPLG00000001100
JH385385 EnsemblGenomes snoRNA 132041 132171 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000691 PARENT=gene:EMDPLG00000000691
JH384885 EnsemblGenomes snoRNA 373733 373807 . + . ID=transcript:EMDPLT00000000689 PARENT=gene:EMDPLG00000000689
Tabelle 1: Danaus plexippus snoRNAs

JH384466 EnsemblGenomes snoRNA_gene 3802 3872 . + . ID=gene:EMDPLG00000000567
JH387043 EnsemblGenomes snoRNA_gene 5457 5539 . - . ID=gene:EMDPLG00000000463
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 3565 3770 . - . ID=gene:EMDPLG00000001034
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 3566 3770 . - . ID=gene:EMDPLG00000000648
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 13611 13815 . + . ID=gene:EMDPLG00000000130
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 13611 13816 . + . ID=gene:EMDPLG00000000761
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 16200 16401 . + . ID=gene:EMDPLG00000000734
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 16200 16402 . + . ID=gene:EMDPLG00000000278
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 17661 17866 . - . ID=gene:EMDPLG00000000682
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 17662 17866 . - . ID=gene:EMDPLG00000000872
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 19003 19207 . + . ID=gene:EMDPLG00000000771
JH383709 EnsemblGenomes snoRNA_gene 19003 19208 . + . ID=gene:EMDPLG00000000983
JH386205 EnsemblGenomes snoRNA_gene 2746 2816 . - . ID=gene:EMDPLG00000000939
JH392349 EnsemblGenomes snoRNA_gene 27144 27214 . + . ID=gene:EMDPLG00000000021
JH383628 EnsemblGenomes snoRNA_gene 24820 24952 . - . ID=gene:EMDPLG00000001075
JH383628 EnsemblGenomes snoRNA_gene 26329 26458 . - . ID=gene:EMDPLG00000000826
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA_gene 7322 7391 . - . ID=gene:EMDPLG00000000452
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA_gene 7566 7635 . - . ID=gene:EMDPLG00000000969
JH383512 EnsemblGenomes snoRNA_gene 7786 7866 . - . ID=gene:EMDPLG00000000019
JH384338 EnsemblGenomes snoRNA_gene 65834 65965 . - . ID=gene:EMDPLG00000000586
JH384078 EnsemblGenomes snoRNA_gene 51538 51673 . + . ID=gene:EMDPLG00000000808
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA_gene 48204 48403 . + . ID=gene:EMDPLG00000000230
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA_gene 49371 49569 . + . ID=gene:EMDPLG00000000731
JH390212 EnsemblGenomes snoRNA_gene 50207 50340 . + . ID=gene:EMDPLG00000001100
JH385385 EnsemblGenomes snoRNA_gene 132041 132171 . + . ID=gene:EMDPLG00000000691
JH384885 EnsemblGenomes snoRNA_gene 373733 373807 . + . ID=gene:EMDPLG00000000689
Tabelle 2: Danaus plexippus snoRNA_genes

Darstellung der Intersect Ergebnisse


Bild 2: Darstellung des Vergleiches des Vorkommens der snoRNA Gene in dpl1 bzw. dpl3
Daten: Vergleich1 (bedtools intersect -a D.plexippus.gff -b dpl3_sort_merge.bed -wao)

Bild 3: Darstellung des Vergleiches des Vorkommens der snoRNA Gene in dpl1 bzw. dpl3
Daten: Vergleich2 (bedtools intersect -a dpl3_sort_merge.bed -b D.plexippus.gff -wao)

Bild 4: Darstellung der gefunden Sequenzen, die in beiden Sequenzen vorkommen
Daten: snoRNA in beiden Sequenzen

Darstellung der Alignment-Ergebnisse


Bild 5: Darstellung des Clustalw Alignments
Daten: ClustalW_Alignment

Bild 6: Darstellung der C/D Boxen und der Strukturen
Daten: Stockholm-Alignment