Das Flussdiagramm in Abbildung 1 zeigt die Durchführung der nötigen Arbeitsschritte. Als Resultat erwarten wir die Sekundärstruktur jeder miRNA. Dabei ist zu beachten, dass diese Strukturen über die Menge der in der miRNA Registry [1] gefundenen miRNA und der mit blastall jeweils in den verschiedenen Organismen gefunden miRNA erstellt wurde. Desweiteren werden mit den Alignments der einzelnen miRNAs phylogenetische Bäume generiert. Mit der Applikation ERPIN wird eine Suche basierend auf der Sekundärstruktur vorgenommen. Die Ergebnisse der blast und erpin Suche werden in einer Tabelle im Abschnitt 3.1 gezeigt.
