Praktikum-Modul 2: "Community Structures in biologischen Netzwerken"

Cluster.

Es wurden zwei verschiedene Varianten des Chinese Whispers Algorithmus verwendet, um die Cluster zu berechnen: top und dist. Top summiert über alle Nachbarklassen. Dist reduziert den Einfluss eines benachbarten Knoten mit seinem Grad (Anzahl der Kanten des Knotens).

Zu jeder Variante wurden mehrere Clusterungen duchgeführt, da es sich um einen Algorithmus mit stochastischem Hintergrund handelt, können sich bei jedem neuen Versuch andere Cluster ergeben.

Weiterhin wurden untere Schranken (threshold) für das minimale Kantengewicht zwischen zwei Wiesen festgelegt.

Repräsentative Graphen für die Graph-Methode und für die Matrix-Methode.

Verschiedene Farben bedeuten verschiedene Cluster.











Maria Herberg
Stephanie Kehr