Bioinformatik von RNA- und Proteinstrukturen (Modul 10-202-2208)
| Vorlesung: | Raum 109, Härtelstr. 16-18; oder digital | |
| Übung: | Raum 006, Härtelstr. 16-18; oder digital | |
| Praktikum: | In Praesenz in Raum 109, Härtelstr. 16-18 Zeitraum 20.06.2022 - 1.07.2022 (Mo-Fr). Der Zeitraum für jede Studentin bzw. jeden Studenten ist 2 Wochen. Anmeldung | |
| Prüfung: | Anmeldung Ort: Haertelstr. 16-18, Raum 109 |
Anmeldung |
Fuers Praktikum benoetigte Programme
Idealerweise bringen Sie bitte einen eigenen Laptop mit.
Programme, die wir vewenden werden:
- blast+ / Diamond
- clustalx oder o
- GBlocks
- aliview
- Splitstree or Geneious
- BUSCO
- DISOPRED3
- pymol
- (opttional) Alphafold
Webbasierte tools:
- string-db
- NCBI (blast und andere)
- iTol
- ODiNPred
- (optional) Robetta (Registrierung notwendig)
Coronavirus
Wir erwarten, dass Vorlesungen und Übungen in Präsenz stattfinden. Wir müssen uns aber darauf einstellen, dass dies auch kürzfristig ändern könnten.
Wir benutzen Moodle zusätzlich zu dieser Webseite. Um diesen Kurs in Moodle zu finden, rufen Sie https://moodle2.uni-leipzig.de/ auf, dann navigieren: --> Fakultät für Mathematik und Informatik --> Institut für Informatik --> Sommersemester 2022 --> Bioinformatik von RNA- und Proteinstrukturen
Themenübersicht der Vorlesungen
| VL | Datum | Raum | Uhrzeit | Thema |
|---|---|---|---|---|
| VL 1 | 04.04.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Bernhart |
| ÜB 1 | 04.04.22 | R 006 | 17:15 | Dr. Bernhart |
| VL 2 | 11.04.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Weinberg: (1) Wichtige allgemeine Ratschläge für Bioinformatiker, (2) Kovariation |
| ÜB 2 | 11.04.22 | R 006 | 17:15 | Dr. Weinberg |
| VL 3 | 25.04.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Bernhart |
| ÜB 3 | 25.04.22 | R 006 | 17:15 | Dr. Bernhart |
| VL 4 | 02.05.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Weinberg: Algorithmen für Kovariation |
| ÜB 4 | 02.05.22 | R 006 | 17:15 | Dr. Weinberg |
| VL 5 | 09.05.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Weinberg: Formale Grammatiken und Vorhersage der RNA-Struktur |
| ÜB 5 | 09.05.22 | R 109 | 17:15 | Dr. Weinberg. |
| VL 6 | 16.05.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Weinberg: Formale Grammatiken und Homologsuche |
| ÜB 6 | 16.05.22 | R 109 | 17:15 | Dr. Weinberg. Hinweis: Laptop mitbringen, wenn möglich |
| VL 7 | 23.05.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Bernhart |
| ÜB 7 | 23.05.22 | R 006 | 17:15 | Dr. Bernhart |
| VL 8 | 30.05.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Bernhart |
| ÜB 8 | 30.05.22 | R 109 | 17:15 | Dr. Bernhart. Hinweis: Laptop mitbringen, wenn möglich |
| VL 9 | 13.06.22 | R 109 | 10:15 | Dr. Bernhart |
| ÜB 9 | 13.06.22 | R 006 | 17:15 | uebungspdf |