Bioinformatisches Praktikum: Modul "Transkriptionsregulation"

Ort: Härtelstr. 16-18, Raum 320.6
Kursteil: 01.08.- 05.08.2005; 10:00 Uhr

Abschlussbesprechung:
Veröffentlichung der Protokolle: Eine Woche nach der Abschlussbesprechung

Für den Praktikumsschein sind zumindest zwei Module zu absolvieren. Es wird jedoch im eigenen Interesse dringend empfohlen, wenn möglich in jedem Semester des Hauptstudiums ein Modul zu absolvieren um einen Überblick über der Fach zu erhalten!

Thema

Viel Gene eukaryotischer Genome werden sowohl zeitlich als auch raeumlich differentiell reguliert. Besonders Gene die fuer die Entwicklung des Organismus entscheidend sind, scheinen einer strengen Kontrolle zu unterliegen, welche sich ueber lange evolutionaere Zeitraeume erhalten hat. Schon geringe Aenderungen koennen drastische Auswirkungen auf den Phaenotyp des Organismus haben. Wir wollen uns diese Information zu nutzte machen um regulatorische Regionen in Hox Gene Clustern zu finden und ihre Veraenderungen waehrend der Evolution der Wirbeltiere zu studieren. Dazu stehen uns sehr unterschiedliche Tools zur Verfuegung.

Methoden

Homologiebasierenden Methoden:

Ueberrepresentierte Motive finden:

Bekannte Transkriptionsfaktorbindungsstellen