Bioinformatisches Praktikum: Modul "Nukleinsäuren"

Montag 03. - Freitag 07. April 2006

Vorbesprechung am 2.2.06 15:15 Uhr Raum 109


Auswertung am 20.6.06 18:30 Raum 320.6

email an alle angemeldeten Studenten: praws05@bioinf.uni-leipzig.de

Das Praktikum findet in der Härtelstrasse 16-18 im Raum 320.6 (Studentenpool) statt.

Thematik

In den Genomen verschiedener Bakterien sollen nicht-kodierende RNA Gene identifiziert werden. Mit Hilfe von Tools zur Bestimmung multipler genomweiter Alignments, Vorhersage von RNA Sekundärstrukturen und Sequenz-Struktur-basierten Vorhersage Methoden sollen ncRNA Kandidaten aus den Genomen extrahiert und analysiert werden.

Am Ende des Praktikums sollen die Ergebnisse in Form eines kurzen Vortrags (15min) vorgestellt und im Internet auf der Bioinformatik Website zur Verfügung gestellt werden.

Informationen/Literatur

Phylogenien, sowie Infos zu einzelnen Organismen Auflistung der sequenzierten Genome/ Download Publicationen zur Verwendung / Download der benötigten Programme