Einführung in die Bioinformatik der RNA- und Proteinstrukturen
News
Vorlesung
Einführung in die Bioinformatik der RNA- und Proteinstrukturen (Vorlesung, Modul 10-202-2208): Mo, 12:45 -16:00 Uhr, R 109, Härtelstr. 16-18
| Vorlesung | Link | Titel | ||||||||||||||||||||||||
| 08.04.2013 |
10-202-2208_VL01_a.pdf 10-202-2208_VL01_b.pdf |
Einführung Thermodynamische Faltung von RNA |
||||||||||||||||||||||||
| 15.04.2013 | 10-202-2208_VL02.pdf | RNA Strukturvorhersage | ||||||||||||||||||||||||
| 22.04.2013 | 10-202-2208_VL03.pdf | Kinetik von RNA Sekundärstrukturfaltung | ||||||||||||||||||||||||
| 29.04.2013 | 10-202-2208_VL04.pdf | Sequenz-/Strukturalignments | ||||||||||||||||||||||||
| 06.05.2013 | 10-202-2208_VL05.pdf | RNA Alignment | ||||||||||||||||||||||||
| 13.05.2013 | 10-202-2208_VL06.pdf | Der Sankoff-Algorithmus | ||||||||||||||||||||||||
| 27.05.2013 | 10-202-2208_VL07.pdf | Die Sprache der RNA | ||||||||||||||||||||||||
| 03.06.2013 | 10-202-2208_VL08.pdf | Proteinstrukturen und die dritte Dimension |
Literatur
M. Höchsmann, T. Töller, R. Giegerich and S. Kurz (2003). Local Similarity in RNA Secondary Structures. CSB '03 Proceedings of the IEEE Computer Society Conference on Bioinformatics. S. 159.G.Steger (2003). Bioinformatik - Methoden zur Vorhersage von RNA- und Proteinstrukturen. Birkhäuser. ISBN 3-7643-6951-5
R.Durbin, S.Eddy, A. Krogh & G.Mitchison (1998). Biological sequence analysis. Cambridge University Press. ISBN 0-521-62971-3
Nussinov, R., Piecznik, G., Griggs, J. R. & Kleitman, D. J. (1978). Algorithms for loop matching. SIAM J Appl Math, 35, 68-82.
Ivo L. Hofacker, Walter Fontana, Peter F. Stadler, L. Sebastian Bonhoeffer, Manfred Tacker, and Peter Schuster. Fast Folding and Comparison of RNA Secondary Structures. Monatsh.Chem. 125: 167-188 (1994).