Maschinelles Lernen und Evolutionaere Algorithmen in der Bioinformatik

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Vorlesung

Maschinelles Lernen und Evolutionaere Algorithmen in der Bioinformatik (Spezialvorlesung, Modul 10-202-2206):
Mo, 14:45 -15:45 Uhr, R 109, Härtelstr. 16-18

VorlesungLinkTitel
08.10.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_01.pdf
10-202-2206_BioinfSpezialVO_02.pdf
Einführung
Hidden Markov Model (HMM)
15.10.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_03.pdf Anwendung HMM (HMMER), SCFG (Infernal)
22.10.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_04.pdf Support Vector Machines
29.10.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_05.pdf Lineare Klassifikation
12.11.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_06.pdf Cluster Analyse
19.11.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_07.pdf Selbstständiges Lernen
26.11.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_08.pdf Evolution und Algorithmen
10.12.2012 10-202-2206_BioinfSpezialVO_09.pdf Beispiele für evolutionäre Algorithmen

Literatur

Profile Hidden Markov Models. S. R. Eddy. Bioinformatics, 14:755-763, 1998. [pdf]
Infernal 1.0: Inference of RNA Alignments. E. P. Nawrocki, D. L. Kolbe, S. R. Eddy. Bioinformatics, 25:1335-1337, 2009.[pdf]
The Elements of Statistical Learning. T. Hastie, R. Tibshirani, J. Friedman. Springer, ISBN 0-387-95284, 2001. [pdf] (763 Seiten, 13MB!)