Ergebnisse Strukturen <title> </head> <body style="font-family:'Arial'"> <h2>Ergebnisse </h2> <h3>Vorhersagen möglicher Sekundärstrukturen</h3> <dir> <li> Suche nach konservierten Strukturelementen in der ausgeschnittenen genomischen Sequenz <br> ➪ mit <a href="Strukturen/RNAz/RNAz_finalcut_Genomicfold.html" target="_blank">RNAz</a> <br> ➪ mit <a href="Strukturen/T-coffee_finalcut_RNAfold_5UTR.html" target="_blank">R-Coffee</a> <li> Suche nach Strukturen in der 5'UTR der mRNA-Sequenzen (RNAfold und RNAalifold): <br> <br> <table align="center" cellspacing="10"> <tr> <th align="center">Konsensus</th> <th align="center">Homo sapiens</th> <th align="center">Mus musculus</th> </tr> <tr> <td> <a href="Strukturen/all_mRNA_finalcut_RNAalifold.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/all_mRNA_finalcut_RNAalifold.png" alt="Konsensustruktur aller mRNAs RNAalifold" </a> </td> <td> <a href="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Homo.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Homo.png" alt="Struktur 5UTR Mensch RNAfold" </a> </td> <td> <a href="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Mus.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Mus.png" alt="Struktur 5UTR Maus RNAfold" </a> </td> </tr> <tr> <td align="center">ΔG = -32,57 kcal/mol </td> <td align="center">ΔG = -189,60 kcal/mol</td> <td align="center">ΔG = -182,19 kcal/mol</td> </tr> <tr><td> </td><td> </td><td> </td> </tr> <tr><td> </td><td> </td><td> </td> </tr> <tr> <th align="center">Gallus gallus</th> <th align="center">Xenopus laevis</th> <th align="center">Danio rerio</th> </tr> <tr> <td> <a href="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Gallus.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Gallus.png" alt="Struktur 5UTR Huhn RNAfold" </a> </td> <td> <a href="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Xenopus.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Xenopus.png" alt="Struktur 5UTR Frosch RNAfold" </a> </td> <td> <a href="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Danio.png" target="_blank"> <img width="300"src="Strukturen/RNAfold/finalcut_mRNA_Danio.png" alt="Struktur 5UTR Fisch RNAfold" </td> </tr> <tr> <td align="center">ΔG = -138,66 kcal/mol </td> <td align="center">ΔG = -108,60 kcal/mol</td> <td align="center">ΔG = -122,03 kcal/mol</td> </tr> </table> <li> die Suche nach <a href="Strukturen/Pseudoknot_prediction/">Pseudoknoten</a> mit vsfold brachte kein einheitliches Ergebnis </dir> <table align="center"> <tr> <td width="250"> <a href="ergebnisse_alignments.htm">zurück zu den Alignments</a> </td> <td width="50"> </td> <td width="250"></td> </tr> </table> </body> </HTML>