mir-191 Cluster

Übersicht über das Cluster

Das mir-191 Cluster besteht aus 2 Familien mir-191 und mir-425. Es ist in allen Tetrapoda einmal zu finden. Das reveres Komplement der dre-mir-462 passt sehr gut zu der mir-191 Familie.
Die Alignments und Sequenzdatei sowie Genompositionen und Bäume sind hier verfügbar:

Fasta von mir-191 | Alignment von mir-191 | Baum von mir-191

Fasta von mir-425 | Alignment von mir-425 | Baum von mir-425

Genompositionen | Namensmapping zur MiRBase

Evolutionäre Geschichte

Abbildung: Übersicht über die vermutliche evolutionäre Entwicklung des mir-191 Clusters
Download als eps

Im Cluster lagen zunächst die mir-191 und die mir-425 getrennt durch mehrere tausend Basen getrennt nebeneinander. Dieser Abstand verkürzte sich immer weiter. So beträgt der Abstand im X. tropicalis rund 3500 Basen. Im O. anatinus ist er auf rund 2700 Basen verkürzt und im M. domestica sogar auf 2600 Basen. Bei diesen 3 Tetrapoda beinhalten die Zwischenstücke repeat regions. In den Eutheria sind zwischen 762 und 779 Basen zwischen der mir-191 und der mir-425. Das Zwischenstück beinhaltet keine annotierten Bereiche.

Abbildung: Konservierung des mir-191 Clusters in Homo sapiens
Download als eps