Repeats eleminieren

Die Sequenzen werden in eine einzelne Datei zusammengefasst und an das Censor Webinterface (http://www.girinst.org/censorhttp://www.girinst.org/censor) geschickt. Censor sucht nach bekannten/auffälligen Repeats und ersetzt diese durch den Buchstaben N. Das Resultat wird anschliessend so zerschnitten, dass wir für jedes HoxCluster eine .fasta Datei erhalten. Dies geschieht durch das Script splitCensor.pl.