Zusammenfassung




Bei TNF handelt es sich um ein homotrimeres Protein, das bei der Entstehung von inflammatorischen und apoptotischen Prozessen eine Rolle spielt.
Weiterhin ist es in der Lage PKR zu aktivieren. Dies hat eine Inhibition der Translation zur Folge. Die Identifizierung von Motiven, die in der Lage sind, PKR
zu aktivieren, stand im Mittelpunkt dieses Praktikums. 
Bisher publizierte Ergebnisse beschreiben die zentrale Rolle eines stemloops in der 3'UTR der mRNA von TNFalpha. 
Mittels ClustalW konnte die 3'UTR des Menschen erfolgreich gegen entsprechende 3'UTR anderer Mammalia aligniert werden. Bis auf Beutel- und Nagetiere wurde 
auch in allen anderen Mammalia der postulierte Stemloop gefunden. Die anschliessenden Strukturalignments mittels locaRNA wiesen vergleichbare Stemloops auf. 
Diese wurden aus anderen Sequenzen aufgebaut. Inwiefern diese Strukturen in der Lage sind, PKR zu aktivieren, bleibt fraglich. 
 


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