mir-232 Cluster

Der mir-232 Cluster ist kein Cluster im eigentlichen Sinne, da er nur aus einer microRNA besteht.Allerdings bestand in der früheren miRBase-Version ein doppelter Eintrag für die mir-232, sodass man davon ausging es handele sich um mehrere Familien. Da dieser Irrtum nun ausgeräumt ist, hat man nur noch eine einzelne miRNA-Familie. Die gegebenen Inputsequenzen wurden nur auf den korrespondierenden Chromosomen wiedergefunden. D.h. die microRNA ist Caenorhabditis spezifisch und kommt in keinen weiteren Organismen vor. Beide Sequenzem sind schon in der miRBase annotiert.

Die Sequenzen mit genomischen Positionen ist hier verfügbar:
Fasta des mir-232 Clusters

Abbildung: Aufbau des mir-232 Clusters
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Eine Rekonstruktion der evolutionsspezifischen Geschichte ist nun relativ trivial, da beide miRNAs nur im C.elegans und C.briggsae vorkommen, d.h. sie sind wahrscheinlich nach der Abspaltung der Strongyloidea entstanden. Um dies genauer abzuklären müsste man die Sequenzen noch gegen verschiedene Genome der Gattung Caenorhabditis bzw andere Nematoden blasten (vorrangig im Trace Archive).
Jedoch ist die Wahrscheinlichkeit, dass es sich um hochspezifische microRNAs handelt hoch, sodass man davon ausgehen kann dass diese Familie Ceanorhabditis-spezifische Entwicklungsprozesse steuert. Allerdings wurde in der Tarbase und Wormbase kein Hinweis auf eine bisher bekannte Aufagbe gefunden.