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Results for CNB 244427_2
Input Alignment
CLUSTAL W(1.81) multiple sequence alignment
244427_ENSMUSG00000036888_MOUSE_6983_7489/1-510 ATTTCTGTAAATGGTGTCTCCAAAGGGCCGCCGCATTATTCAGCTGGCTTTATCAGCTGG
244427_ENSRNOG00000002457_RAT_6069_6575/1-510 ATTTCTGTAAATGGTGTCTCCAAAGGGCCGCCGCATTATTCAGCTGGCTTTATCAGCTGG
244427_ENSDARG00000015073_ZEBRAFISH_4427_4928/1-510 ATTTCAGTAAATGGTGTCTC-AGATGACTCCGGCATTATTCAACGGGCTTTATCAGCACT
244427_ENSG00000163064_HUMAN_6937_7444/1-510 ATTTCTGTAAATGGTGTCTCCAAAGGGCCGCCGTATTATTCAGCTGGCTTTATCAGCTGG
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244427_2.aln
RNAz output
############################ RNAz 0.1 ##############################
Sequences: 4
Columns: 300
Mean pairwise identity: 84.16
Mean single sequence MFE: -90.98
Consensus MFE: -67.01
Energy contribution: -69.95
Covariance contribution: 2.94
Mean z-score: -1.57
Structure conservation index: 0.74
SVM decision value: 0.16
SVM RNA-class probability: 0.609967
Prediction: RNA
######################################################################
>244427_ENSMUSG00000036888_MOUSE_6983_7489/1-510
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>244427_ENSRNOG00000002457_RAT_6069_6575/1-510
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>244427_ENSDARG00000015073_ZEBRAFISH_4427_4928/1-510
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>244427_ENSG00000163064_HUMAN_6937_7444/1-510
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>consensus
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244427_2.rnaz
RNAalifold consensus structure
Stefan Washietl
Last modified: Thu Aug 12 14:35:44 CEST 2004
