2. Beschaffung und Installation der Software

Verwendete Software

Es wurde für die Durchführung des Praktikums eine Reihe von Software verwendet. Hier ist eine Auflistung der verwendeten Programme, jeweils versehen mit einem Link auf eine Seite wo das entsprechnde Programm zum Download bereit steht.

clustalw (paarweises und multiples Alignment)

code2aln (Alignment Programm)

phylip (Programm zur Erzeugung eines phylogenetischen Baumes)

SplitsTree (Programm zur Erzeugung eines phylogenetischen Baumes)

ViennaRNA Package 1.5 beta + alidot (Programmpaket zur Berechnung von RNA- Sekundärstrukturen)

Alidot (Programm zur Detektierung konservierter RNA- Sekundärstrukturen)

Clustalw und code2aln sind Programme zum bestimmen paarweiser oder multipler Alignments. Beide Programme wurden für das Bestimmen der Alignments eingesetzt und die Ergebnisse miteinander verglichen. Phylip und Splitstree wurden für die Berechnung phylogentischer Bäume eingesetzt. Das Vienna RNA-Package wurde vorallem für die Berechnung

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