| Sequence ID | pao.964 |
|---|---|
| Location | 1,724,058 – 1,724,172 |
| Length | 114 |
| Max. P | 0.986295 |
| Location | 1,724,058 – 1,724,172 |
|---|---|
| Length | 114 |
| Sequences | 6 |
| Columns | 119 |
| Reading direction | reverse |
| Mean pairwise identity | 78.31 |
| Mean single sequence MFE | -43.10 |
| Consensus MFE | -24.20 |
| Energy contribution | -24.55 |
| Covariance contribution | 0.35 |
| Combinations/Pair | 1.26 |
| Mean z-score | -3.04 |
| Structure conservation index | 0.56 |
| SVM decision value | 2.04 |
| SVM RNA-class probability | 0.986295 |
| Prediction | RNA |
Download alignment: ClustalW | MAF
>pao.964 1724058 114 - 6264404 CAUCGGUAUGGCCACUACAGAUCCCGCAGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUGGUCAUAUUUUUC---AAAUC-U-GGGCCAUGGCUUUGUGAGCUUGGCCCGCUUAGUU ....((((((((((.....(....)((((...((((((((....))))))))....))))))))))))))....---.....-.-((((((.(((((...)))))))))))........ ( -45.90) >pss.1219 2329474 112 - 6093698 CUGUAUCA-AGUCACCAGGGAUCACGCAGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUGGUCUCAUUUCUUCA-AAAUA-A-GAGCCGCAGCUUUGCGAGCU---ACUGCUCAGGU ........-....(((.(((((((.((((...((((((((....))))))))....))))))))))).........-.....-.-((((.(.(((((...)))))---.).)))).))) ( -43.60) >pel.2087 1960665 113 + 5888780 CUGAACCA-CGCCACCU-GGAUCCUGCUGAUUUUCCGGGUACCAGCCCGGAAGCCCCUGCUGGUCUCAUAUCUUCAUAGGUA-AUGAGCGCGGGCUUUGUGGGCC---CUUGCUCGGGU ....(((.-.(((((((-(((............)))))))((((((..((....))..))))))..............))).-.((((((.(((((.....))))---).))))))))) ( -43.50) >pf5.1027 1921663 113 - 7074893 CCAAAACA-AGCCACUUAGGAUCACGCUGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUUGUCUCAUUUCUUCA-AAAUAUA-GAGCAGCCACUUUGUGAGCU---GCUGCUCAGGU ((...(((-(((.....((((((.....))).((((((((....))))))))...)))))))))............-.......-(((((((..(((...)))..---))))))).)). ( -37.20) >pfo.903 1802859 110 - 6438405 CCAAAACA-AGCCACUUAGGAUCACACUGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUUGUCUCAUUUCUUCA-AAAUA-A-GAGCCGCAGC-UUAUG-GCU---GCUGCUCUGGU ((...(((-(((.....((((((.....))).((((((((....))))))))...)))))))))............-.....-(-((((.(((((-.....-)))---)).))))))). ( -40.90) >pst.1324 2419287 112 - 6397126 CUGUAUCA-AGUCACCAGGGAUCACGCAGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUGGUCUCAUUUCUUCA-AAAUA-A-GAGCGGCAGCUUUGCGAGCU---ACUGCUCAGGU ........-....(((.(((((((.((((...((((((((....))))))))....))))))))))).........-.....-.-((((((.(((((...)))))---.)))))).))) ( -47.50) >consensus CUGAAACA_AGCCACCAAGGAUCACGCAGAUAGUCCGGGUACCAGCCCGGAUGCCCCUGCUGGUCUCAUUUCUUCA_AAAUA_A_GAGCCGCAGCUUUGUGAGCU___ACUGCUCAGGU .............(((..((((((.((.....((((((((....))))))))......))))))))...................((((...((((.....))))......)))).))) (-24.20 = -24.55 + 0.35)
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