| Sequence ID | pao.930 |
|---|---|
| Location | 1,668,929 – 1,669,047 |
| Length | 118 |
| Max. P | 0.999947 |
| Location | 1,668,929 – 1,669,047 |
|---|---|
| Length | 118 |
| Sequences | 6 |
| Columns | 120 |
| Reading direction | forward |
| Mean pairwise identity | 88.96 |
| Mean single sequence MFE | -68.47 |
| Consensus MFE | -70.42 |
| Energy contribution | -67.20 |
| Covariance contribution | -3.22 |
| Combinations/Pair | 1.27 |
| Mean z-score | -4.56 |
| Structure conservation index | 1.03 |
| SVM decision value | 4.76 |
| SVM RNA-class probability | 0.999947 |
| Prediction | RNA |
Download alignment: ClustalW | MAF
>pao.930 1668929 118 + 6264404 --GCAAUGGUGGCCCUGUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUCAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGCGGGGCCGCCUCC --.....(((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))))))))... ( -68.90) >pau.2098 2561899 118 - 6537648 --GCAAUGGUGGCCCUGUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUCAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGCGGGGCCGCCUCC --.....(((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))))))))... ( -66.80) >pel.989 1854966 118 + 5888780 --GUCGUGGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCC --...(.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))...))).)))).))))).).)))))))))))))))).). ( -72.90) >ppk.2459 1323355 120 - 6181863 AUGUAGUGGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCC .....(.(((((((((((((((((((((((((((((..(((((((...((((....(((....)))....)))))))))))...))).)))).))))).).)))))))))))))))).). ( -72.80) >pf5.1142 2115305 120 + 7074893 UCGUUAUGGUGACCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGUUGCCUCC .......((..(((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))))..))... ( -64.80) >pfo.1033 2014270 120 + 6438405 UCGUUAUGGUGACCCUAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUGAACCUGGUCAGAGCCGGAAGGCAGCAGCCACAGCGGGAACAUUGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUAGGGUUACCACC ......((((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))))))))).. ( -64.60) >consensus __GUAAUGGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUCAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCC .......(((((((((((((((((((((((((((((..(((((.....((((....(((....)))....))))..)))))...))))).)).))))).).))))))))))))))))... (-70.42 = -67.20 + -3.22)
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