Locus 25

Sequence ID pao_1
Location 1,668,934 – 1,669,051
Length 117
Max. P 0.865755
window84

overview

Window 4

Location 1,668,934 – 1,669,051
Length 117
Sequences 6
Columns 117
Reading direction forward
Mean pairwise identity 84.49
Mean single sequence MFE -57.08
Consensus MFE -44.11
Energy contribution -43.03
Covariance contribution -1.08
Combinations/Pair 1.14
Mean z-score -2.87
Structure conservation index 0.77
SVM decision value 0.85
SVM RNA-class probability 0.865755
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>pao_1 1668934 117 + 1
UGGUGGCCCUGUCGGUCCCCCCGCAACGAUUACCCGUCAACCUGGUCAGGUCCGGAAGGAAGCAGCCACAGCGGGAACAUCGUGUGCCGGGGUGUGGCUGGCGGGGCCGCCUCCAUU
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>pau_1 1 117 + 1
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>pf5_1 1 105 + 1
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>pfo_1 1 101 + 1
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>pfs_1 1 105 + 1
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>ppk_1 1 117 + 1
UGGUGGCCCCAUCGGUCCCCCCGCAUUGAUUACCCGUUAACCUGGUCAGGCCCGGAAGGGAGCAGCCAUAGCGGGAACAUCGAGUGCCGGGGUGUGGCUGGUGGGGCCGCCUCCAUU
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>consensus
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alignment

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