| Sequence ID | X_DroMel_CAF1 |
|---|---|
| Location | 19,347,526 – 19,347,643 |
| Length | 117 |
| Max. P | 0.919264 |
| Location | 19,347,526 – 19,347,643 |
|---|---|
| Length | 117 |
| Sequences | 5 |
| Columns | 117 |
| Reading direction | reverse |
| Mean pairwise identity | 89.40 |
| Mean single sequence MFE | -48.12 |
| Consensus MFE | -41.92 |
| Energy contribution | -41.52 |
| Covariance contribution | -0.40 |
| Combinations/Pair | 1.25 |
| Mean z-score | -1.67 |
| Structure conservation index | 0.87 |
| SVM decision value | 1.13 |
| SVM RNA-class probability | 0.919264 |
| Prediction | RNA |
Download alignment: ClustalW | MAF
>X_DroMel_CAF1 19347526 117 - 22224390 GGGUGAGGGAUUCUUCUGACGUGUCAUUGGCCUGGAACGCUGUAACGGGCGACGGGAUGAUUCAGUCUUGGAUUUGUUGCGGCGCUUCCUCGUCAUGCUGCCACCCAGCACUCCCUU ....((((((......(((....))).((((..((((((((((((((((...((((((......))))))..)))))))))))).))))..))))(((((.....))))).)))))) ( -43.40) >DroSec_CAF1 7051 117 - 1 GCGCGAGGGAGUCUGCUGACGUGUCAUUGGCCUGGAGCGUUGUGACAGGCGACGGGACGAUUCAGUCUUGGAUUUGUUGCGGCGCUUCCUUGUCAUGCUGUUACCCAGCACUCCCUU ....((((((((..((((..(((.((.((((..(((((((((..(((((...((((((......))))))..)))))..)))))).)))..))))...)).))).)))))))))))) ( -52.00) >DroSim_CAF1 7794 117 - 1 GCGCGAGGGAGUCUGCUGACGUGUCAUUGGCCUGGAGCGUUGUGACGGGCGACGGGACGAUUCAGUCUUGGAUUUGUUGCGGCGCUUCCUUGUCAUGCUGUCACCCAGCACUCCCUU ....((((((((..((((..(((.((.((((..(((((((((..(((((...((((((......))))))..)))))..)))))).)))..))))...)).))).)))))))))))) ( -54.10) >DroEre_CAF1 7160 117 - 1 GGGCGAGGGAGUCUGCUGACGUAUCAUCGGCUUGGAGCGUUGUGACGGGCGAUGGGAUGAUUCAGUCUUGGAUUUAUAGCGGCGCUUCCUCCUCAUGCUGUCACCCAGCACUCCCUC (((.((((((((((((((.(((..(((((.((((..((...))..)))))))))..)))((((......))))...)))))).))))))))))).(((((.....)))))....... ( -43.00) >DroYak_CAF1 6613 117 - 1 GGGCGAGGGAGUCUGCCGACGUAUAAGCGGCCUGGAGCGUUGUGACGGGCGACGGGAUGAUUCAGUCUUGGAUUUGUAGCGGCGCUUCUUCCUUAUGCUGUCACUCAGCACUCCUUC ....(((((((((((..((((((((((.((...((((((((((.(((((...((((((......))))))..))))).)))))))))).))))))))).)))...))).)))))))) ( -48.10) >consensus GGGCGAGGGAGUCUGCUGACGUGUCAUUGGCCUGGAGCGUUGUGACGGGCGACGGGAUGAUUCAGUCUUGGAUUUGUUGCGGCGCUUCCUCGUCAUGCUGUCACCCAGCACUCCCUU ....(((((((((((..(((((((.((.((...((((((((((((((((...((((((......))))))..)))))))))))))))))).)).)))).)))...))).)))))))) (-41.92 = -41.52 + -0.40)
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