Locus 4922

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 12,913,009 – 12,913,129
Length 120
Max. P 0.933702
window8057

overview

Window 7

Location 12,913,009 – 12,913,129
Length 120
Sequences 4
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 97.36
Mean single sequence MFE -54.30
Consensus MFE -52.24
Energy contribution -52.93
Covariance contribution 0.69
Combinations/Pair 1.04
Mean z-score -2.23
Structure conservation index 0.96
SVM decision value 1.23
SVM RNA-class probability 0.933702
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 12913009 120 - 27905053
UGGCUGGCAUGGUUGGUGGCCACAUGCUCCUCGUGGCUGUGGUUGUUGCUACUGCUGCUGCAGCUGGCAACCAGCGCGGCGUUAUUUGCAUGGAAUGAUUCACGUUGGCUGCUGCGGCGC
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>DroSec_CAF1 9613 120 - 1
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>DroEre_CAF1 1485 120 - 1
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>DroYak_CAF1 1485 120 - 1
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>consensus
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alignment

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