Locus 4411

Sequence ID 3R_DroMel_CAF1
Location 11,647,072 – 11,647,192
Length 120
Max. P 0.500000
window7202

overview

Window 2

Location 11,647,072 – 11,647,192
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 92.33
Mean single sequence MFE -37.96
Consensus MFE -33.50
Energy contribution -32.22
Covariance contribution -1.28
Combinations/Pair 1.20
Mean z-score -1.15
Structure conservation index 0.88
SVM decision value -0.06
SVM RNA-class probability 0.500000
Prediction OTHER

Download alignment: ClustalW | MAF

>3R_DroMel_CAF1 11647072 120 - 27905053
UCGGUGAGGAUUCUAUUUCUUCGGGCGGACUCACUGAUGCUGGCUGCGAUUCUGUGCAAUCGUCACAGUAUAUAGUUGCUAUGUUUCGCUUGAAGUUGACCUCGUCCACCUGUACCCGAU
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>DroSec_CAF1 27918 120 - 1
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>DroSim_CAF1 30115 120 - 1
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>DroEre_CAF1 25818 120 - 1
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>DroYak_CAF1 28406 120 - 1
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>consensus
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