Locus 2228

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>3R_DroMel_CAF1 6344346 93 + 27905053
----UGUUGC-------UGCCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCCGCCAUAAUUAUGGCAAC--CAGCAACAACAACAU----G-----CAUUUC
----((((((-------((.(((....))).((((((..(((((.......))))).))))))..(((((....)))))...--)))))))).......----.-----...... ( -31.20)
>DroSim_CAF1 122687 93 + 1
----UGUAGC-------UGCCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAAC--CAGCAACAACAACAU----G-----CAUUUC
----(((.((-------((..((((.((((.((((((..(((((.......))))).)))))))))).........))))..--)))).))).......----.-----...... ( -28.80)
>DroEre_CAF1 120283 98 + 1
----UGUUGC-------UGCCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAAC--CAGCUACAACAACAU----GCAAUUCUGUUC
----(((.((-------((..((((.((((.((((((..(((((.......))))).)))))))))).........))))..--)))).))).......----............ ( -28.80)
>DroWil_CAF1 198709 87 + 1
----UGCUGU-------UGGCUGUCUGCAAUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUUGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAACUCCAACAACAACAACA-----------------
----((.(((-------(((..((.......((((((.((((((.......)))))))))))).((((((....)))))))).)))))).))......----------------- ( -29.20)
>DroYak_CAF1 109858 106 + 1
CUGUUGUUGC-------UGCCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAAC--CAGCAACAGCAACAACAAGGACAUUCAUUUC
.(((((((((-------((..((.(((.((.((((((..(((((.......))))).))))))))(((((....)))))...--))))).))))))))))).............. ( -39.60)
>DroAna_CAF1 111171 91 + 1
----UGCAGUUCUGGCGUGGCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAAC--CGGCAGCAACAAC------------------
----((((....(((((((((((....)))).)))))))..))))............((..(((((((((....))))))..--.))).))......------------------ ( -33.40)
>consensus
____UGUUGC_______UGCCUGUCUGCAGUGCGCGCCAAAUGUAAACAAAAUAUUCGCGCGCCUGCCAUAAUUAUGGCAAC__CAGCAACAACAACAU____G_____CAUUUC
....(((.((.......((((.....((((.((((((..(((((.......))))).)))))))))).........))))......)).)))....................... (-21.44 = -21.69 +   0.25) 

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>3R_DroMel_CAF1 6344346 93 - 27905053
GAAAUG-----C----AUGUUGUUGUUGCUG--GUUGCCAUAAUUAUGGCGGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGGCA-------GCAACA----
......-----.----....((((((((((.--((((((((....)))))((((((((.((.....((....)).)).)))))).))...))).))))-------))))))---- ( -35.90)
>DroSim_CAF1 122687 93 - 1
GAAAUG-----C----AUGUUGUUGUUGCUG--GUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGGCA-------GCUACA----
......-----.----.(((.((((((.(((--.(((((((....)))))))((((((.((.....((....)).)).))))))....)))...))))-------)).)))---- ( -32.10)
>DroEre_CAF1 120283 98 - 1
GAACAGAAUUGC----AUGUUGUUGUAGCUG--GUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGGCA-------GCAACA----
............----.(((((((((..(((--.(((((((....)))))))((((((.((.....((....)).)).))))))....)))....)))-------))))))---- ( -35.40)
>DroWil_CAF1 198709 87 - 1
-----------------UGUUGUUGUUGUUGGAGUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCAAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCAUUGCAGACAGCCA-------ACAGCA----
-----------------.((((((((((((....(((((((....)))))))((((((((((...........)))).))))))......))))).))-------))))).---- ( -32.50)
>DroYak_CAF1 109858 106 - 1
GAAAUGAAUGUCCUUGUUGUUGCUGUUGCUG--GUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGGCA-------GCAACAACAG
..............(((((((((((((.(((--.(((((((....)))))))((((((.((.....((....)).)).))))))....)))...))))-------))))))))). ( -44.50)
>DroAna_CAF1 111171 91 - 1
------------------GUUGUUGCUGCCG--GUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGCCACGCCAGAACUGCA----
------------------((.((((((((.(--.(((((((....)))))))((((((.((.....((....)).)).)))))).).)))).)))).))((.......)).---- ( -33.30)
>consensus
GAAAUG_____C____AUGUUGUUGUUGCUG__GUUGCCAUAAUUAUGGCAGGCGCGCGAAUAUUUUGUUUACAUUUGGCGCGCACUGCAGACAGGCA_______GCAACA____
..................(((((((((((.....(((((((....)))))))((((((.((.....((....)).)).))))))...)))).))...........)))))..... (-26.60 = -26.10 +  -0.50) 

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