Locus 4816

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 13,489,208 – 13,489,316
Length 108
Max. P 0.500000
window7590

overview

Window 0

Location 13,489,208 – 13,489,316
Length 108
Sequences 6
Columns 108
Reading direction forward
Mean pairwise identity 80.62
Mean single sequence MFE -37.40
Consensus MFE -21.73
Energy contribution -20.98
Covariance contribution -0.74
Combinations/Pair 1.26
Mean z-score -1.70
Structure conservation index 0.58
SVM decision value -0.06
SVM RNA-class probability 0.500000
Prediction OTHER

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 13489208 108 + 23771897
UGUCAGUGAAGAUGAAGCCGCAGCCACUCCCGACAGAGACAAUGUGGAGCUGUGGACAGCGCAUCGCAUUAUGGGAUGGCUGCAGACCAUCGACCUGUCUGAAUACAC
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>DroPse_CAF1 1402 108 + 1
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>DroEre_CAF1 1662 108 + 1
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>DroYak_CAF1 1923 108 + 1
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>DroAna_CAF1 1644 108 + 1
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>DroPer_CAF1 1402 108 + 1
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>consensus
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