Locus 2784

Sequence ID 3L_DroMel_CAF1
Location 7,902,537 – 7,902,657
Length 120
Max. P 0.814315
window4344

overview

Window 4

Location 7,902,537 – 7,902,657
Length 120
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 93.72
Mean single sequence MFE -46.18
Consensus MFE -40.41
Energy contribution -40.05
Covariance contribution -0.36
Combinations/Pair 1.10
Mean z-score -1.61
Structure conservation index 0.87
SVM decision value 0.66
SVM RNA-class probability 0.814315
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>3L_DroMel_CAF1 7902537 120 - 23771897
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>DroVir_CAF1 4225 120 - 1
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>DroSec_CAF1 1832 120 - 1
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>DroWil_CAF1 1931 120 - 1
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>DroMoj_CAF1 3992 120 - 1
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>DroAna_CAF1 1695 120 - 1
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>consensus
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