Locus 5763

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 18,263,214 – 18,263,319
Length 105
Max. P 0.615030
window9233

overview

Window 3

Location 18,263,214 – 18,263,319
Length 105
Sequences 6
Columns 105
Reading direction forward
Mean pairwise identity 84.19
Mean single sequence MFE -38.75
Consensus MFE -28.97
Energy contribution -29.17
Covariance contribution 0.20
Combinations/Pair 1.34
Mean z-score -1.96
Structure conservation index 0.75
SVM decision value 0.17
SVM RNA-class probability 0.615030
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 18263214 105 + 20766785
CUACGUCACCGUCCAGGAUGUUCGUGCCAUUAUGGUCGUCCUGGGCGAAGUCGUAACCGAUGACGAUAUUAAGGAUAUCUGCCAAGCAGUCGAUAUGGAUGGCGA
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>DroSec_CAF1 60295 105 + 1
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>DroSim_CAF1 61768 105 + 1
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>DroEre_CAF1 62603 105 + 1
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>DroYak_CAF1 61548 105 + 1
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>DroAna_CAF1 60503 105 + 1
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>consensus
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