Locus 3625

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 12,018,870 – 12,018,966
Length 96
Max. P 0.999210
window5900

overview

Window 0

Location 12,018,870 – 12,018,966
Length 96
Sequences 6
Columns 96
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 98.38
Mean single sequence MFE -24.93
Consensus MFE -24.70
Energy contribution -24.70
Covariance contribution -0.00
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -1.79
Structure conservation index 0.99
SVM decision value 3.44
SVM RNA-class probability 0.999210
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 12018870 96 - 20766785
GUGUCCAUUGUUUAUUUAUAAUCCCAGCAACUAGUGCGCUGAUUGAGUUGCCCAAGUUGAGGAGCGCAUAAAUUUGCAUUAUAGAUCGACACACAA
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>DroSec_CAF1 20340 94 - 1
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>DroSim_CAF1 20632 94 - 1
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>DroEre_CAF1 20177 94 - 1
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>DroYak_CAF1 19925 94 - 1
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>DroAna_CAF1 16062 94 - 1
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>consensus
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alignment

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Postscript

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