Locus 1584

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 5,943,073 – 5,943,193
Length 120
Max. P 0.561821
window2655

overview

Window 5

Location 5,943,073 – 5,943,193
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 96.42
Mean single sequence MFE -44.96
Consensus MFE -42.98
Energy contribution -42.94
Covariance contribution -0.04
Combinations/Pair 1.10
Mean z-score -1.08
Structure conservation index 0.96
SVM decision value 0.06
SVM RNA-class probability 0.561821
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 5943073 120 - 20766785
CUCCACGGCGUUGGCGUCUAUGGUCUCGGCUAUAGCGUUUGCGUCUAUAAUCAGUGGCGGCUGCUGUUCGUUAAGAUCCUGCGAUCCGGAGUCCUGCUCGUCCAGAUCUUCGAGAAGCAG
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>DroSec_CAF1 85154 120 - 1
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>DroSim_CAF1 83023 120 - 1
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>DroEre_CAF1 70308 120 - 1
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>DroYak_CAF1 87905 120 - 1
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>consensus
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alignment

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