Locus 151

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 1,418,205 – 1,418,321
Length 116
Max. P 0.956298
window336

overview

Window 6

Location 1,418,205 – 1,418,321
Length 116
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 90.70
Mean single sequence MFE -37.24
Consensus MFE -35.32
Energy contribution -35.80
Covariance contribution 0.48
Combinations/Pair 1.08
Mean z-score -1.51
Structure conservation index 0.95
SVM decision value 1.46
SVM RNA-class probability 0.956298
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 1418205 116 - 20766785
UCAUAUGUAUACCAACAGGCACUGGAUUGUACG----GAGUGCAGGUCGGUCCGUGAAAAUGGCCAGAAUAUGCAGAGCUAUGGCGGCCCAAAUUCUGUUUAUUUUGGCUGUCGCACAUC
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>DroSec_CAF1 36685 116 - 1
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>DroSim_CAF1 41697 116 - 1
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>DroEre_CAF1 35238 115 - 1
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>DroYak_CAF1 35993 112 - 1
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>consensus
UUAUAUGUAUACCAACAGGCACUGGAUUGUACG____GAGUGCAGGUCGGUCCGUGGAAAUGGCCAGAAUAUGCAGAGCUAUGGCGGCCCAAAUUCUGUUUAUUUUGGCUGUCGCACAUC
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alignment

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