Locus 1283

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 5,021,698 – 5,021,818
Length 120
Max. P 0.810556
window2222

overview

Window 2

Location 5,021,698 – 5,021,818
Length 120
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 95.33
Mean single sequence MFE -53.35
Consensus MFE -44.48
Energy contribution -45.82
Covariance contribution 1.33
Combinations/Pair 1.00
Mean z-score -2.14
Structure conservation index 0.83
SVM decision value 0.65
SVM RNA-class probability 0.810556
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 5021698 120 - 20766785
CUUGGAUAGUCCAUGGCAUGGGCCAUCGGUGGUCUGCUGGCGCUCCGGCUGCGAUGGUGACCCGCUCCGGCCGGACUGGUUGGCUCAUCCAUGUCGCGGUAGUAUGGACUGCCCAUUGCU
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>DroVir_CAF1 3315 120 - 1
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>DroGri_CAF1 2515 120 - 1
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>DroWil_CAF1 11178 120 - 1
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>DroMoj_CAF1 3407 120 - 1
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>DroAna_CAF1 2108 120 - 1
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>consensus
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alignment

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