Locus 1179

Sequence ID 2R_DroMel_CAF1
Location 4,686,115 – 4,686,235
Length 120
Max. P 0.622125
window2064

overview

Window 4

Location 4,686,115 – 4,686,235
Length 120
Sequences 6
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 80.28
Mean single sequence MFE -47.37
Consensus MFE -35.46
Energy contribution -35.05
Covariance contribution -0.41
Combinations/Pair 1.38
Mean z-score -1.21
Structure conservation index 0.75
SVM decision value 0.18
SVM RNA-class probability 0.622125
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2R_DroMel_CAF1 4686115 120 - 20766785
AUUGGUGCUGCGGGCCAUUAUUGAAGAAGGCGAGCUGCAAGUGGCUCAGCAAAUGCAAGCAUUGGCUUUGGAUGAGGCUGCGCUGUGCCGCCACUUACUGGUGGCACUGUAUACGCCCUC
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>DroVir_CAF1 6954 120 - 1
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>DroGri_CAF1 7143 120 - 1
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>DroWil_CAF1 7010 120 - 1
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>DroMoj_CAF1 6755 120 - 1
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>DroAna_CAF1 11225 120 - 1
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>consensus
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alignment

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