Locus 4601

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 13,175,082 – 13,175,200
Length 118
Max. P 0.587866
window7259

overview

Window 9

Location 13,175,082 – 13,175,200
Length 118
Sequences 6
Columns 118
Reading direction forward
Mean pairwise identity 81.75
Mean single sequence MFE -45.27
Consensus MFE -25.68
Energy contribution -26.43
Covariance contribution 0.75
Combinations/Pair 1.41
Mean z-score -2.16
Structure conservation index 0.57
SVM decision value 0.11
SVM RNA-class probability 0.587866
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 13175082 118 + 22407834
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>DroVir_CAF1 19722 118 + 1
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>DroGri_CAF1 47928 118 + 1
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>DroWil_CAF1 80669 118 + 1
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>DroMoj_CAF1 61759 118 + 1
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>DroAna_CAF1 15770 118 + 1
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>consensus
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alignment

Postscript

secondary structure

Postscript

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Postscript

Generated by rnazCluster.pl (part of RNAz 1.0) on Mon Dec 4 11:22:12 2006