Locus 385

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>2L_DroMel_CAF1 1201984 104 + 22407834
AUGCGAUU---UUCGCAAUAGACCCACCCCGUUUGUGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGCGGUCGAAUCCCAAUCGAAUCGGGGUGGGUG
.((((...---..))))....(((((((((((((((((.(((..........))).)))....((((((((....))))))))........)))).)))))))))). ( -42.50)
>DroSec_CAF1 16313 104 + 1
AUGCGAUU---UUCGCAAUGGACCCACCCCGUUUGUGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGCGGUCGAAUCCCAAUCGAAUCGUGGUGGGUA
.((((...---..))))....(((((((.(((((((((.(((..........))).)))....((((((((....))))))))........)))).)).))))))). ( -35.40)
>DroSim_CAF1 19034 104 + 1
AUGCGAUU---UUCGCAAUGGACCCACCCCGUUUGUGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUCCAUCUGCGGUCGAAUCCCAAUCGAAUCGUGGUGGGUA
.((((...---..))))....(((((((.((((((((((((((........((.(((........))).))...)))))))).........)))).)).))))))). ( -34.00)
>DroEre_CAF1 18204 99 + 1
---CGAGU---UUCGCAGUAGACCCGCCCCUUU-GCGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGCGGUUCAAUCCC-AUCGAAUCGGGGUGGGCG
---.....---.........(.((((((((...-.(((.(((..........))).......(((((((((....)))).)))))...-.)))....))))))))). ( -30.70)
>DroYak_CAF1 18957 104 + 1
AUGCGAGU---UUCGCAAUAGAGCCACCCCUUUGGCGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGCGGUUCAAUCGCAAUCGAAUCGGGGUGGGUG
.((((...---..))))....(.(((((((((((((((.(((..........)))........((((((((....)))).))))))))...))))..))))))).). ( -34.00)
>DroPer_CAF1 31821 107 + 1
AUCUGUCUUGAAACGCACUGUACCCCUUCCUCUUCAGCCCGCAAUCACUCAACCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGUAUUGGAUUCCAGAUCGAUCCAAGGGGAAGG
........................((((((((..(((...(((.(((.................))).)))..)))..(((((((.......))))))))))))))) ( -22.63)
>consensus
AUGCGAUU___UUCGCAAUAGACCCACCCCGUUUGUGACCGCAAUCACUCAGGCGUUUAAUAAUUGACUGCAUCUGCGGUCGAAUCCCAAUCGAAUCGGGGUGGGUG
.(((((......)))))....(((((((........(((((((((((.((((...........)))).)).)).)))))))...((......)).....))))))). (-21.39 = -22.03 +   0.64) 

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Window 9

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>2L_DroMel_CAF1 1201984 104 - 22407834
CACCCACCCCGAUUCGAUUGGGAUUCGACCGCAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCACAAACGGGGUGGGUCUAUUGCGAA---AAUCGCAU
.((((((((((((((.....))))..((((((((...((.(((.............))).)).)))))))).....))))))))))....((((..---...)))). ( -43.72)
>DroSec_CAF1 16313 104 - 1
UACCCACCACGAUUCGAUUGGGAUUCGACCGCAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCACAAACGGGGUGGGUCCAUUGCGAA---AAUCGCAU
.(((((((.((((((.....))))..((((((((...((.(((.............))).)).)))))))).....)).)))))))....((((..---...)))). ( -36.62)
>DroSim_CAF1 19034 104 - 1
UACCCACCACGAUUCGAUUGGGAUUCGACCGCAGAUGGAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCACAAACGGGGUGGGUCCAUUGCGAA---AAUCGCAU
.(((((((.((((((.....))))..((((((((((...)))..........(((....)))..))))))).....)).)))))))....((((..---...)))). ( -33.90)
>DroEre_CAF1 18204 99 - 1
CGCCCACCCCGAUUCGAU-GGGAUUGAACCGCAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCGC-AAAGGGGCGGGUCUACUGCGAA---ACUCG---
.((((.(((((((((...-.)))))((.((((((...((.(((.............))).)).))))))))..-...)))).))))..........---.....--- ( -31.02)
>DroYak_CAF1 18957 104 - 1
CACCCACCCCGAUUCGAUUGCGAUUGAACCGCAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCGCCAAAGGGGUGGCUCUAUUGCGAA---ACUCGCAU
...(((((((....(((((((((((((...((....))..))))))......(((....)))...))))))).....)))))))......((((..---...)))). ( -36.60)
>DroPer_CAF1 31821 107 - 1
CCUUCCCCUUGGAUCGAUCUGGAAUCCAAUACAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGGUUGAGUGAUUGCGGGCUGAAGAGGAAGGGGUACAGUGCGUUUCAAGACAGAU
((((((.((((((((......).))))....(((.((((((((....((((....)))).))))))))..)))))).))))))..........(((....))).... ( -29.20)
>consensus
CACCCACCCCGAUUCGAUUGGGAUUCGACCGCAGAUGCAGUCAAUUAUUAAACGCCUGAGUGAUUGCGGUCACAAAAGGGGUGGGUCCAUUGCGAA___AAUCGCAU
.(((((((((((.((......)).)).(((((((...((.(((.............))).)).))))))).......)))))))))....(((((......))))). (-24.49 = -25.97 +   1.48) 

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