Locus 3687

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 10,736,638 – 10,736,758
Length 120
Max. P 0.589079
window5816

overview

Window 6

Location 10,736,638 – 10,736,758
Length 120
Sequences 5
Columns 120
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 93.42
Mean single sequence MFE -49.12
Consensus MFE -42.02
Energy contribution -42.70
Covariance contribution 0.68
Combinations/Pair 1.10
Mean z-score -1.26
Structure conservation index 0.86
SVM decision value 0.11
SVM RNA-class probability 0.589079
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 10736638 120 - 22407834
CUGCUGUUUCCGGAACUGGAAUCGCCGCCACAGCGGUGAUGCGUCCCGAGCUGGUGAUGAAGUCCAUCAUUCCGGUGGUCAUGGCGGGCAUCAUUGCCAUAUACGGUCUGGUGGUAUCCG
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>DroSec_CAF1 5979 120 - 1
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>DroSim_CAF1 5987 120 - 1
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>DroEre_CAF1 5983 120 - 1
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>DroYak_CAF1 6087 120 - 1
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>consensus
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alignment

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