Locus 1956

Sequence ID 2L_DroMel_CAF1
Location 5,276,803 – 5,276,920
Length 117
Max. P 0.981550
window3166

overview

Window 6

Location 5,276,803 – 5,276,920
Length 117
Sequences 5
Columns 118
Reading direction reverse
Mean pairwise identity 90.46
Mean single sequence MFE -30.86
Consensus MFE -24.74
Energy contribution -25.06
Covariance contribution 0.32
Combinations/Pair 1.14
Mean z-score -2.36
Structure conservation index 0.80
SVM decision value 1.89
SVM RNA-class probability 0.981550
Prediction RNA

Download alignment: ClustalW | MAF

>2L_DroMel_CAF1 5276803 117 - 22407834
CAAGUCACGUACGAAGUGGCGAUACAACUUCUGGUUAUGUAUGCAAAAUUGCAUAGUAAACAGAUUUUGUUUAAUCGUUA-UUAUUGCUGAUACAGUAGAGCAUGCCUAAGUAGCACU
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>DroSec_CAF1 52332 114 - 1
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>DroSim_CAF1 58627 117 - 1
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>DroEre_CAF1 48201 117 - 1
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>DroYak_CAF1 56031 117 - 1
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>consensus
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