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Ausgangsbasis für die Suche nach Bindungsstellen von Transkriptionsfaktoren sind die Position der Hox-Gene auf dem Huhn-Genom (Feb. 2004 freeze, Genome Sequencing Center at Washington University in St. Louis). Dazu gehören die Autosomen 1-24, 26-28 und 32, die Gonosomen W und Z und als virtuelles Chromosom ``chrM'', die mitochondriale Sequenz.