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Zur Steuerung des Transkriptionsprozesses enthält eukaryotische proteincodierende DNA
Damit hat ein eukaryotischen Gens die folgende Struktur:
Der basale Promotor enthält den Transkriptionsstart und allgemeine Transkriptionsfaktorbindungsstellen. Der basale Promotor enthält die TATA-Box, die Initiator-Box Inr, das Downstream-Promotor-Element (DPE), das TFIIB Recognition Element (BRE) und die CCAAT-Box.
Der proximalen Promotor erstreckt sich einige Hundert Basenpaare upstream und downstream des Transkriptionsstarts und enthält einige spezifische Transkriptionsfaktorbindungsstellen verteilt über einen relativ großen Bereich.
Der distale Promotor sind sämtliche weiteren spezifischen Sequenzen, die sich downstream innerhalb des Gens befinden.
Bis zu mehreren Kilobasen vor dem ersten transkribierten Nukleotid können sich Enhancer- und Silencer-Elemente befinden.
