Aufgabenstellung
In den Genomen verschiedener Bakterien sollen nicht-kodierende RNA
Gene identifiziert werden. Mit Hilfe von Tools zur Bestimmung
multipler genomweiter Alignments, Vorhersage von RNA
Sekundärstrukturen und Sequenz-Struktur-basierten Vorhersage
Methoden sollen ncRNA Kandidaten aus den Genomen extrahiert und
analysiert werden.
Am Ende des Praktikums sollen die
Ergebnisse in Form eines kurzen Vortrags (15min) vorgestellt und im
Internet auf der Bioinformatik Website zur Verfügung gestellt
werden.
Wir befassten uns mit den Bakterienarten: