MicroRNAs (miRNAs) sind kleine nicht-kodierende RNA Moleküle die stark konserviert
sind und die Expression von Genen regulieren. Da sich die Sequenzen von miRNAs im Laufe der Evolution nur schwach verändern, können ähnliche Strukturen in verschiedenen Organismen Aufschluss über stammesgeschichtliche Verwandtschaftsbeziehungen zwischen den Organismen geben. Es wird die Precursor RNA benutzt, also die Sequenz, die im Nukleus der Zelle kurz nach der Transkription eine Sekundärstruktur mit den charakteristischen Hairpins bildet. Ziel war das Auffinden von ähnlichen miRNA Sequenzen in verschiedenen Organismen und die Erstellung eines phylogenetischen Baums über diese Sequenzen.
