Bioinformatik Modul
Transkriptionsregulation

Andrej Aderhold, Jakob Mümel

Oktober 2005

Zusammenfassung:

Im menschlichen Genom kommen etwa 25000 Gene vor, die lediglich 5 % der gesamten DNA Sequenz ausmachen. Etwa 45 % bestehen aus DNA, die funktionaler Natur ist. Darunter fallen die Transkriptionfaktor Bindestellen (TFBS). Das sind cis-wirkenden kurzen DNA Sequenzen mit i.d.R. 6 - 12 Basenpaare die als Rezeptoren für Transkriptionfaktoren dienen und in dem regulatorischen Bereich eines Gens vorkommen. Die TFBS entwickeln eine zentrale Rolle bei der Regulation von Genen. Vom besonderen Interesse sind die Regulationsrezeptoren an den Hox Genen, die in der Ontogenese eine entscheidende Rolle spielen. In diesem Praktikum untersuchen wir die Regulatorregion von Hox Genen des Zebrafischs, Kugelfisch und Grünen Kugelfisch auf DNA Motive, die Bindungsmotive sein können.