Results of 123D+ run

Database of 4381 domains
Matrix: gonnet
Secondary structure prediction
Contact Capacity Potentials
Contact Capacity Potentials
Penalty for Gap opening: -10.000000
Penalty for Gap extension: -1.000000
Q_Seq: T0214 length: 110a.a.
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     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHH               HHHHE       
-----MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYD---------------EKRRQIKPG---
     |. || : :|||***||: :||:  | |               .| . | .*   
AALAEIVAQLNIYQSQVELIQQQMEAVRATISELEILEKTLSDIQGKDGSETLVPVGAGS
 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTTTEEEEEEEETTE

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----------DVISFEGGKLKVRVKAIRVYNSFREMLE--KEGLENVLPGVKSIEEGIQV
          |**|  *. | |: |   : |*||| ||  |. *||| .   :*||.|: 
FIKAELKDTSEVIMSVGAGVAIKKNFEDAMESIKSQKNELESTLQKMGENLRAITDIMMK
EEEEEETTTTEEEEEEETTEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH

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YRRFYDEEKEKK-YGVVAIEIEPLEY
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LSPQAEELLAAVA.............
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s_m = 499 s_ss = 61 s_cc = 234 go = -200 ge = -150
     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHH     HHHHE    EEEEEE   EEEE
-----MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYD-----EKRRQIKPGDVISFEGGKLKVR
     |  |    ||||| *.  *:||* .|.|     *| |:|. :. |  | *:|.|*
QNVQHQLAQFQQLQQQAQAISVQKQTVEMQINETQKALEELSRAADDAEVYKSSGNILIR
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* | .  |.:.*      **.|    *|**|  |   . .:* |||   .|         
VAKDELTEELQEK-----LETLQLREKTIERQEERVMKKLQEMQVNIQEAMK........
E HHHHHHHHHHH     HHHHHHHHHHHHHHHHHGUGGTTTUHHHHHH U         


seq 1h99A 467 127 0.00 -100000.00 113 21
s_m = 895 s_ss = 30 s_cc = 92 go = -300 ge = -290
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EE EEEE   EEEEEEHEHEHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDV-ISFEGGKLKVRVKAIRVYNS
    *   ..  ||||.  | |: .               *.*|.| *  .    |    
....MPNIINITKVMEEILSIVKYHF-------------KIEFNEESLHYYRFVTDLKFF
     HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH                 TTTTHHHHHHHHHHHHH

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FREMLEKEGLENVLPG-----VKSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKY---------GVVAIEI
:. | :::.|*: |        ....|| |.::|| | ||||.          | ||*|*
AQRLFNGTHMESEDDFLLDTVKEKYHRAYECTKKIQTYIEREY-EHKLTSDELLYLTIDI
HHHHHH    UU  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH      HHHHHHHHHHH

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EPL--EY
* |    
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HHHH   


seq 4ubpA 449 111 0.00 -100000.00 106 7
s_m = 707 s_ss = -3 s_cc = 118 go = -300 ge = -70
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNSF
    *:* .: .* : . .    |: . ||  .||   .| . .| |   |:| .  |..
....MHLNPAEKEKLQIFLASELLLRRKARGLKLNYPEAVAIITSFIMEGARDGKTVAML
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REMLEKE-GLENVLPGVKSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAIEIEPLEY
 *  .:: . |.* |** .| : **|   * *  *      * || :*|: 
MEEGKHVLTRDDVMEGVPEMIDDIQAEATFPDGTK-----LVTVH-NPIS.
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seq 1dxxA 434 127 0.00 -100000.00 109 15
s_m = 578 s_ss = 26 s_cc = 138 go = -200 ge = -170
  HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEE          EE   EE
--MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVIS----------FEGGKLK
   *|*   ||.* . |::  :*..    :.  .:|: * :||          ..  *|:
DSYEREDVQKKTFTKWVNAQFSKFGKQHIENLFSDLQDGRRLLDLLEGLTGQKLPKEKGS
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VRVKAIRVYNSFREMLEKEGLENVLPGVKSI-----EEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAI
 ** *|:: *   |:*||::|. *  *|..*     | || . .:|.  ||         
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EIEPLEY
       
.......
       


seq 1esfA 422 137 0.00 -100000.00 70 3
s_m = 944 s_ss = -27 s_cc = 106 go = -300 ge = -300
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNSF
                  .**| |:* ... ||  * |:|:.| ::|.*: ||:|.    
.................EEKKVPINLWLDGKQNTVPLETVKTNKKNVTVQELDLQA----
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-REMLEKEGLENVLPGVKSIEEGIQVYR--------------------RFYDEEKEKK-Y
 * |:**. * * .  . ||.:*  *||                    :|   :|||*  
RRYLQEKYNLYNSDVFDGKVQRGLIVFHTSTEPSVNYDLFGAQGQYSNTLLRIYRDNKTI
HHHHHHHHTTTT GGG     EEEEEEETTTT  EEEETTT     HHHHHGGGTTT EE

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 :  ||*||        
NSENMHIDIYLYTS...
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seq 1eq3A 416 128 0.00 -100000.00 46 0
s_m = 785 s_ss = -8 s_cc = 10 go = -200 ge = -180
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNSF
                                .|*  |||| : **|: |:|:|   :|*
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                                 EEEEEEEE    HHHHHHHHH TTTHH

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:*|.|| ..|.   *:|           .|.*||    .       * *:  : *:*  .
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HHHHHHHTTTTTTTT EEEEETTT    HHHHHHH     TTTTTTTTTTTEEETTEEEE

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*:|* |: 
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seq 1fs1B 411 111 0.00 -100000.00 53 4
s_m = 481 s_ss = 5 s_cc = 130 go = -200 ge = -20
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   E EEEEEHEHEHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKL-KVRVKAIRVYNS
                                   *  |||  :*:| .*:*  | : :|
...................................PSIKLQSSDGEIFEVDVEIAKQSVT
                                    EEEEETTTT EEEEEGGGGG  HH

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FREMLEKEGLENVLPGVKSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAIEIEPLEY
||:***:.* |.* *  :   :|||   :  |: *|:              
IKTMLEDLGMDPV-PLPNVNAAILKKVIQWCTHHKDD..............
HHHHHHHH TTEE ETTTT HHHHHHHHHHHHHHTTT              


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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEE    E   EEEEEEHEHE
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISF----EGGKLKVRVKAIRV
                            |.  ||. *|.|.|    :| : ..*|:    
...........................MPNNGRVIFGATVTVLNLDSDEEQTYRIVGDDE
                           T    EETTTEEEEEEETTTTEEEEEEEETTTT

HHHHHHHH HH    H     HH HHHHHHEHHHHHHHHHHHHHEEEEEEE    HH
YNSFREML-EKEGLENVLPGVKS-IEEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAIEI-EPLEY
 |       :|  |: . * : : *.. |..   | .|  *. | *|:|*       
AD------FKQNLISVNSPIARGLIGKEEDDVVVIKTPGGEVEFEVIKVEYL.....
TT      GGG EEETTTHHHHHHTTEETTEEETTUUUUUUTTEEEEEEE       


seq 1efuB 397 119 0.00 -100000.00 78 6
s_m = 534 s_ss = 29 s_cc = 84 go = -200 ge = -90
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEH       
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKA-------
                                 .| * :|| :|*.:.|:|         
................................VAADGVIKTKIDGNYGIILE-VNCQTDF
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|   |.*:|:.|*.. | *  |: ||*.| : : :  ::  :*    | * :|: **  
VAKDAGFQAFADKVLDAAVAGKITDVEVLKAQFEEERVALVAKIGENINIRRVAALEG.
HHH HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHHHHHHHH    EEEEEEEEET 


seq 1ecmA 388 113 0.00 -100000.00 97 2
s_m = 455 s_ss = 3 s_cc = 130 go = -200 ge = -50
HHHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHH
MEWEMGLQEEFL-ELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNS
*  * .*:|.   * *.: ||*|   *::. .  ::.*|    :|  |    .. . .|:
MTSENPLLAL--REKISALDEKLLALLAERRELAVEVGKAKLLSHRPVRDIDRERDLLER
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FREMLEKEGLENVLP--GVKSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAIEIEPLEY
: |  ||.|*|.       : ||.|*|    |  |  |:|             
LITLGKAHHLDA---HYITRLFQLIIEDSVLTQQALLQQH.............
HHHHHHHH   H   HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH               


seq 1cuk_ 381 119 0.00 -100000.00 76 6
s_m = 663 s_ss = -30 s_cc = 122 go = -300 ge = -90
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE      EEEEEEHEHEH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGG---KLKVRVKAIRVY
                            .* .:    ..*  |*    **  .||...  
............................NKQERTLFKELIKTNG-VGPKLALAILSGMSA
                             HHHHHHHHHHHHTTT T HHHHHHHHHH  H

HHHHHHHHH    H         HHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHH  EEEEEEE   HH
NSFREMLEKEGLENV--LPGV--KSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKY--GVVAIEIEPLEY
|:*:|:|*:* || |  ***|  *:.*||*   .: .|:|.   |              
QQFVNAVEREEVGALVKLPGIGKKTAERLIVEMKDRFKGLHGDLFTP............
HHHHHHHHH  HHHHHHTTTT HHHHHHHHHHHHHHHHH  TTTTTT            


seq 3fapB 379 120 0.00 -100000.00 93 6
s_m = 655 s_ss = 19 s_cc = 210 go = -400 ge = -130
  HHHHHHHHHHHHHHHHH   HHHHHH   EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEH
--MEWEMGLQEEFLELIKL---RKKKIE--GRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKA
  | *   | |* ** :|    ||  ||  :.| || .: |..*   | * . |.   .|
VAILWH-EMWHEGLEEASRLYFGERNVKGMFEVLEPLHAMMERGPQTLKETSFNQAYGRD
    HH HHHHHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHHHHHHHHH    HHHHHHHHHHHHH

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IRVYNSFREMLEKEGLENVLPGVKSIEEGI--QVYRRF-YDEEKEKKYGVVAIEIEPLEY
|.   ::.| :|* * .: *  :|.|      |*|**|                      
LMEAQEWCRKYMKSGNVKDLTQAWDL----YYHVFRRIS.....................
HHHHHHHHHHHHHH  HHHHHHHHHH    HHHHHHHH                      


seq 1e79D 379 128 0.00 -100000.00 97 5
s_m = 840 s_ss = 22 s_cc = 54 go = -300 ge = -250
 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHH
-MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNS
   | :* :|  ||..|: |* ||     ||.  *   * |* *| .| .*:.|*.:| *
MDPNIVGSEH--YDVARGVQKILQDYKSLQDIIAILGMDELSEEDKLTVSRARKIQRFLS
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FREMLEK--EGLENVLPGVK----SIEEGIQVYRRFYDEEKEKKYGVVAIEIEPLE----
         | :|:*: *:|    |::* *| |. | | * |.    . . | *|*    
-------QPFQVAEVFTGHLGKLVPLKETIKGFQQILAGEYDHLPEQAFYMVGPIEEAVA
          GGGHHHH        HHHHHHHHHHHHHTTTTTT GGGGTTT  HHHHHH

       H
-------Y
        
KADKLAE.
HHHHHH  


seq 1mmsA 377 111 0.00 -100000.00 84 14
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EHHHHHHHE    EEEEEE   EEEEEEHEHEHHHH
MEWEMGLQEEFLELIKLRKKKIEGRLYDEKRRQIKPGDVISFEGGKLKVRVKAIRVYNSF
                   *:  :     *  :*|.*.     |.    :* :|    |:
...................KTPPASFLLKKAAGIEKGS-----SEPKRKIVGKV----TR
                       HHHHHHHHH     T     TTTTTTT EEE     H

HHHHHH    H     HHHHHHHHEHHHHHHHHHHHHH EEEEEEE   HH
REMLEKEGLENVLPGVKSIEEGIQVYRRFYDEEKEKKY-GVVAIEIEPLEY
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s_m = 534 s_ss = -15 s_cc = 140 go = -200 ge = -100
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seq 1regX 365 129 0.00 -100000.00 94 10
s_m = 697 s_ss = -2 s_cc = 154 go = -300 ge = -220
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seq 1eu3A 364 135 0.00 -100000.00 91 23
s_m = 830 s_ss = -22 s_cc = 112 go = -300 ge = -280
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seq 1iow_ 362 125 0.00 -100000.00 94 10
s_m = 750 s_ss = 0 s_cc = 28 go = -300 ge = -150
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seq 1abv_ 362 122 0.00 -100000.00 95 3
s_m = 429 s_ss = 23 s_cc = 124 go = -100 ge = -150
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seq 1tolA 359 111 0.00 -100000.00 83 2
s_m = 623 s_ss = 54 s_cc = 58 go = -300 ge = -140
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seq 1b3qA 359 115 0.00 -100000.00 60 3
s_m = 446 s_ss = 5 s_cc = 46 go = -100 ge = -80
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seq 1kgsA 358 129 0.00 -100000.00 88 6
s_m = 750 s_ss = -23 s_cc = 224 go = -400 ge = -190
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s_m = 473 s_ss = -34 s_cc = 76 go = -100 ge = -50
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seq 1jbjA 353 118 0.00 -100000.00 86 5
s_m = 520 s_ss = -35 s_cc = 168 go = -200 ge = -80
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s_m = 525 s_ss = -88 s_cc = 70 go = -100 ge = -60
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seq 1tafB 347 121 0.00 -100000.00 68 9
s_m = 431 s_ss = -3 s_cc = 124 go = -100 ge = -110
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seq 1div_ 345 112 0.00 -100000.00 92 0
s_m = 391 s_ss = 16 s_cc = 14 go = -100 ge = -20
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seq 1opc_ 344 124 0.00 -100000.00 98 6
s_m = 670 s_ss = -74 s_cc = 212 go = -300 ge = -190
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seq 1rl6A 343 115 0.00 -100000.00 89 4
s_m = 585 s_ss = -115 s_cc = 198 go = -300 ge = -50
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seq 1ctf_ 343 110 0.00 -100000.00 55 2
s_m = 475 s_ss = 13 s_cc = 62 go = -200 ge = -30
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seq 1h99A 336 130 0.00 -100000.00 110 17
s_m = 1069 s_ss = -7 s_cc = 78 go = -500 ge = -330
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seq 1pklA 335 133 0.00 -100000.00 68 15
s_m = 980 s_ss = -99 s_cc = 110 go = -400 ge = -230
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seq 1nsa_ 333 121 0.00 -100000.00 38 0
s_m = 755 s_ss = 10 s_cc = 230 go = -400 ge = -270
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seq 1b4aA 332 113 0.00 -100000.00 80 5
s_m = 524 s_ss = -25 s_cc = 120 go = -200 ge = -80
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seq 1jer_ 327 128 0.00 -100000.00 79 5
s_m = 805 s_ss = -30 s_cc = 20 go = -300 ge = -180
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seq 1dq3A 326 119 0.00 -100000.00 79 8
s_m = 577 s_ss = -6 s_cc = 144 go = -300 ge = -100
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seq 2cbp_ 321 111 0.00 -100000.00 70 2
s_m = 730 s_ss = -47 s_cc = -28 go = -300 ge = -30
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seq 1b7tA 318 110 0.00 -100000.00 37 3
s_m = 589 s_ss = -40 s_cc = 168 go = -300 ge = -70
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seq 1sfe_ 315 110 0.00 -100000.00 74 2
s_m = 393 s_ss = -2 s_cc = 24 go = -100 ge = -40
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seq 1aua_ 313 130 0.00 -100000.00 90 9
s_m = 708 s_ss = -21 s_cc = 238 go = -400 ge = -220
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seq 1pkp_ 312 120 0.00 -100000.00 71 9
s_m = 413 s_ss = 29 s_cc = 126 go = -200 ge = -100
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seq 1rl6A 311 122 0.00 -100000.00 20 0
s_m = 647 s_ss = -75 s_cc = 254 go = -400 ge = -130
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seq 1b77A 310 120 0.00 -100000.00 98 4
s_m = 840 s_ss = -36 s_cc = 60 go = -400 ge = -130
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s_m = 932 s_ss = -62 s_cc = 16 go = -400 ge = -170
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seq 1bxyA 306 110 0.00 -100000.00 55 2
s_m = 493 s_ss = 6 s_cc = 154 go = -200 ge = -150
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seq 1jhnA 305 120 0.00 -100000.00 47 7
s_m = 522 s_ss = -28 s_cc = 12 go = -100 ge = -100
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seq 1setA 305 114 0.00 -100000.00 104 2
s_m = 431 s_ss = 1 s_cc = 120 go = -200 ge = -70
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seq 1j8mF 304 117 0.00 -100000.00 84 10
s_m = 593 s_ss = 22 s_cc = 104 go = -300 ge = -150
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